作者通过iTRAQ蛋白质组学技术鉴定敲低NMT1后发生变化的蛋白质。结果鉴定到三种上调蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六种下调蛋白(NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF)(图2A)。作者将这些蛋白质分别命名为N-豆蔻酰化下调蛋白(NDP)和上调蛋白(NUP)。有趣的是,敲低NMT1会减少NDP和NUP的N-豆蔻酰化,而过表达NMT1会诱导NDP和NUP的N-豆蔻酰化(图2B)。在小鼠模型中,敲除NMT1会导致NDP和NUP的去N-豆蔻酰化,这可以通过在肝脏中表达外源性NMT1来部分逆转(图2C)。这些发现表明,尽管NMT1对NDP和NUP的表达起着相反的作用,但NMT1同时刺激NDP和NUP的N-豆蔻酰化。蛋白组学翻译后修饰筛选,检测,鉴定,定性,定量。内蒙古蛋白组学测序上海
为了确定TMT AD蛋白网络模块是否也存在于其他的队列和大脑区域,使用 TMT标记定量蛋白质组学多个队列的所有组织,为每个队列生成蛋白质共表达网络,并评估了 AD 网络模块是否保留在每个队列和大脑区域中。发现几乎所有的 TMT AD 网络模块都保留在队列和大脑区域(图2b)。阿尔茨海默病(AD)是一种神经系统退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文从蛋白组学方向出发,建立蛋白共表达网络,综合转录组学结果,解析疾病相关的蛋白组学模块或能为AD提供可靠的生物标志物,并为治疗带来希望。辽宁蛋白组学itraq欧易鹿明生物蛋白质研究技术。
4D蛋白质组学分析发现,不同的病因和疾病的严重程度中蛋白表达存在差异。严重的疾病同急性期的蛋白的增加,补体系统蛋白及功能相关的蛋白相关;通过COVID-19和健康组对比,发现了49%的差异分析物;和脓毒症相比,G-CSF,IL-8等在严重的COVID-19患者中含量更低;蛋白和临床相关性分析则发现临床特征和某些蛋白呈强相关性。本研究通过4D蛋白组学技术结合其他组学技术及免疫技术,确定了COVID-19免疫特征和宿主反应等相关因素,并为进一步COVID-19的***打下了良好的基础。
作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较,同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类,主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中,普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中,参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性,以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的,作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。蛋白组+代谢组+脂质组-数据分析系统。
蛋白质磷酸化修饰是指在磷酸化激酶的作用下将ATP的磷酸基转移到蛋白质特定氨基酸上的过程,是生物体内**为常见、**为重要的翻译后修饰之一。生物体内蛋白质的磷酸化修饰是一个瞬时且可逆的过程,通过磷酸化修饰可以改变蛋白质空间构象,从而影响蛋白质的定位、活性及其与其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年来,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组学和代谢组学为基础的多层组学整合实验与分析的团队。影响因子:13.511发表时间:2022-01-06发表单位:***医学研究院生物工程研究所运用生物技术:磷酸化蛋白质组学(欧易鹿明提供)、LC-MS靶向代谢组学蛋白组学,研究方法,高通量定性定量研究,有。吉林线粒体蛋白组学
质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学 。内蒙古蛋白组学测序上海
在本研究中,利用iTRAQ标记定量蛋白组学方法对东京野茉莉种子发育的4个时间点采样进行蛋白质组学分析。获得了2338个蛋白和1473个DEPs。Mfuzz聚类分析显示,在种子发育过程中,转录本和蛋白质组之间存在相当大的时序一致性。在四个发育时期中,花后70天(种子发育活跃期)是视为东京野茉莉种仁发育的关键时期:在该阶段与脂肪酸生物合成相关的功能基因和酶蛋白均达到表达峰值,同时种仁内部大部分营养物质开始迅速积累。通过转录组数据和蛋白质组数据综合分析油脂合成的调控网络,乙酰CoA羧化酶和**酸脱氢酶两个酶体系处于中心位置,在脂肪酸的合成过程中具有主导作用。内蒙古蛋白组学测序上海
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